Számítógépes program választja ki a vegyületeket az immunterápia hatékonyságának növelése érdekében
A Cell Reports Medicine folyóiratban megjelent kutatás egy skálázható, adatalapú számítógépes keretrendszert mutat be kombinált immunterápiák tervezéséhez, ami reményt ad azoknak a betegeknek, akik a jelenlegi immunterápiákra nem reagálnak megfelelően. Az immunterápia, különösen az ellenőrzőpont-blokkolók (immune checkpoint blockade, ICB) forradalmasították a rák kezelését. Az ICB-vel szembeni széles körű rezisztencia a klinikai gyakorlat egyik legnagyobb kihívása.
Ezért az ICB-terápia kemoterápiával vagy célzott kezeléssel való kombinálása a kezelés hatékonyságának növelése és a rezisztencia leküzdése érdekében meghatározó kutatási irányzattá vált. A lehetséges kombinációk azonban a meglévő gyógyszerek empirikus kiválasztásán alapulnak, és nehéz új jelölteket találni.
Az ICB terápiával kombinálható gyógyszerek széles körű és automatikus előrejelzésének érdekében a kutatók, Li Hong professzor (Kínai Tudományos Akadémia, Sanghaji Táplálkozás- és Egészségügyi Intézet) és Hu Bo egyetemi docens (Fudan Egyetem, Zhongshan Kórház) vezetésével egy új számítógépes keretrendszert fejlesztettek ki IGeS-BS néven.
Az IGeS-BS először integrálta az immunterápiás kezelésben részesült több ezer beteg transzkriptomikus adatait, és 33 megbízható, az immunválaszra utaló jelzőt azonosított. Ezután ezeket a jelzőket felhasználva meghatározott egy értékelő pontszámot, amely számszerűsítette a vegyületek által kiváltott változásokat a tumor mikrokörnyezetében. Végül az IGeS-BS a vegyületeket az értékelő pontszámuk alapján rangsorolta, az élen álló vegyületek nagyobb valószínűséggel fokozzák az ICB terápiás kezelés hatékonyságát.
Az IGeS-BS alkalmazásával több mint 10 000 vegyületet vizsgáltak 13 rákfajtán, és létrehoztak egy immunválasz-térképet, amely sikeresen rangsorolta a szinergikus potenciállal rendelkező jelölteket. A kísérleti validálás megerősítette, hogy két magas rangú vegyület, az SB-366791 és a CGP-60474, jelentősen visszafordíthatja az anti-PD-1 terápiával szembeni rezisztenciát májrák esetén. Ez a kutatás egy hatékony számítógépes keretrendszert biztosít az immunterápiás hatékonyságot fokozó vagy a rezisztenciát leküzdő vegyületek felfedezéséhez.